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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

退役老兵吴长征打造红色教育基地 让红军营号声永远嘹亮******

　　退役老兵吴长征倾力打造红色教育基地

　　让“红军营”的号声永远嘹亮

　　中国国防报讯郭兴义、武纲报道：南国冬日，寒意逼人，湖南省平江县仙姑岩红军营景区参观者络绎不绝。看着涌动的人流，红军营景区负责人、退役军人吴长征激动地说：“我们一定用好平江红色资源，打造好湘鄂赣边区红色教育基地，助力创建湘赣边区乡村振兴示范区，让红军营的号声永远嘹亮，让红色基因代代相传。”

　　1990年3月，吴长征入伍来到前身是“平江起义”红五军的部队，经历摔打磨炼，成长为一名优秀革命军人。几年后，从部队退伍的吴长征投身商海，在北京站稳脚跟。事业发展越来越好，但吴长征心中的家乡情结始终挥之不去。2007年，他毅然放弃在北京的优渥生活回到家乡，拿出全部积蓄投入红色遗址遗迹保护和开发之中。他深入仙姑岩，认真察看红军哨卡、消息树、红军井、红军医院、指挥所、藏军洞等旧址，查阅《湘鄂赣苏区红军史》和将帅回忆录，下定决心建设仙姑岩红军营景区。经过近10年精心打造，仙姑岩红军营景区成为全国30条红色旅游精品线路的组成部分之一，并被教育部命名为“全国中小学生研学实践教育基地”，被湖南省命名为“全民国防教育基地”。

　　2016年，红军营景区成功申报“国家AAA级旅游景区”，被列入国家“十三五”旅游基础设施和公共服务设施建设专项规划储备项目，被列入湖南省11个贫困村附近重点旅游景区之一，带动周边村民脱贫致富。如今，随着功能不断拓展，景区继续带动周边村庄走上振兴之路。看着村民的日子越来越红火，吴长征心里就像喝了蜜一样甜。前不久，由吴长征牵头负责的《传承红色文化，助推乡村振兴》项目荣获第二届湖南省学校文化建设创新成果二等奖，他本人还被评为岳阳市文旅融合优秀人才。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）